เรื่องภายหลังจากภาคแรก 3 ปีชูยะจัดตั้งขึ้นกลุ่มขบถแล้วก็ขึ้นเป็นหัวหน้าก่อการทำศึกกับพวกผู้ใหญ่ กฏ BR ถูกนำกลับมาใช้อีกครั้งแบบโหดกว่าเดิม ชิโอริบุตรสาวของครูคิตาโนะที่ถูกชูยะยิงตายไปเมื่อภาคที่แล้วอยากค้นหาคำตอบเลยไปสมัครเรียนในโรงเรียนซึ่งมีก็แต่พวกเด็กเหลือขอ แล้วเด็กกลุ่มนั้นก็ถูกเลือกเฟ้นมาเล่นเกมแบบเดียวกับพวกชูยะเป็นถูกพาตัวมาที่ค่ายจับสวมปลอกคอมีครูริกิที่บุตรสาวตายเพราะพวกชูยะก่อกบฏเป็นคนควบคุม เกมนี้แตกต่างจากภาคแรกเป็นให้จับมาแบบเป็นๆคู่ถ้าคู่ตายก็จะต้องถูกระเบิดตายตามไปด้วยและไม่ได้ให้ล่าคุ้นเคยแต่ว่าให้ตามล่าชูยะกับพวกกบฏบนเกาะที่พวกชูยะกบดานอยู่ เกมนรก สถาบันพันธุ์โหด 2
เริ่มภารกิจแรกยังไปไม่ทันถึงเกาะก็เริ่มถูกกลุ่มของชูยะโจมตีตาย และก็ตายอีกในช่วงเวลาที่ไปเก็บลูกกระสุนปืนที่ถูกส่งลงมาจากเรือบิน พวกผู้เรียนตัวหลักๆเป็นทากุกับพวกที่เหลือถูกพวกชูยะล้อมไว้ พวกชูยะใช้ระเบิดทำลายระบบแล้วก็ช่วยถอดปลอกสำหรับใส่คอ ริกิส่งทหารเข้าไปแต่ว่าพวกชูยะจัดแจงได้ ชูยะบอกกระทั่งกลุ่มผู้เรียนยอมเป็นพวกด้วย อยู่ๆสหรัฐฯก็ยิงจรวดนำวิถีลูกแรก นายกสั่งให้ริกิจัดแจงกวาดให้หมดทั้งเกาะริกิเองก็สวมปลอกคออยู่แบบเดียวกัน ชูยะให้พวกผู้เรียนหนีออกทางอุโมงค์ชิโอริไม่ยินยอมไปขออยู่มองจนถึงวินาทีสุดท้าย ทากุกับสหายอีกสองคนเปลี่ยนใจกลับมาสมทบกับชูยะ ริกิมาถึงบอกเรื่องที่ลูกถูกฆ่าในเหตุการก่อกบฏระเบิดที่ปลอกสำหรับใส่คอริกิระเบิด ชิโอริถูกยิงเจ็บถามชูยะก่อนตายถึงโนริโกะชูยะกล่าวว่าโนริโกะเป็นคนที่กล้าจ้องตาแล้วก็ยิ้มให้คนอื่นอย่างจริงใจ ชูยะกับทากุบุกออกไปก่อนที่ทั้งเกาะจะถูกกระหน่ำพวกทากุกับที่เหลือถูกประกาศว่าหายสาบสูญ ทากุกับชูยะตามมาสมทบกับพวกที่เหลือรวมถึงโนริโกะแล้วทั้งหมดทั้งปวงก็รวมตัวกันเดินหน้าต่อไป
